Erzurum ve Sivas Kongrelerinin toplanış şekli bakımından birbirlerinden farklıdır.
Erzurum Kongresinin toplanma kararınını alan ve toplanmasını sağlayan Doğu Anadolu Müdafa-i Hukuku Cemiyeti (MüdafVilayet-i Şarkiyye Osmaniyye Milliye Cemiyeti) ile Trabzon Müdafa-i Hukuku Milliye Cemiyetinin ortak kararları ve uğraşları ile gerçekleşmiştir. Bölgede yaşanan Ermeni ayaklanma, devlet kurma ve işgal çalışmalarına karşı durmak ve örgütleme amacı ile düzenlenmiştir.
Sivas Kongresinin toplanma kararı ve çağrısı Amasya Genelgesi 21-22 Haziran 1919 tarihleri arasında Amasya'da toplantı yapan Mustafa Kemal Paşa ve arkadaşları tarafından alınmıştır. Sivas Kongresi kararı ülkenin büyük bir bölümünün işgal edilmesine karşı çıkmak ve vatanı kurtarmak amacı ile düzenlenmiştir.
Amaçları bakımından birbirine yakın olan ama birbirini tamamlayan ve destekleyen kongrelerdir. Erzurum Kongresi bölgesel olarak düzenlenirken Sivas Kongresi ulusal olarak düzenmiştir.